Für ein funktionierendes Immunsystem ist die gesunde Darmflora und intakte Darmwand unentbehrlich. Sie beinhaltet einen wichtigen Teil des Immunsystems. Das Immunsystem des Darmes stellt das größte Immunorgan des Körpers dar und steht mit den restlichen immunologischen Organsystemen in ständiger Wechselwirkung. Über die Darmwand kommt der menschliche Körper in Kontakt mit der Umwelt. So findet hier in den Immunzellen des Darmes ein permanentes Immuntraining statt. Sie bilden passgenaue Antikörper zur Bekämpfung von Kranheitserregern und können die entsprechenden Informationen für eine zukünftige Immunantwort abspeichern. Die aktivierten Immunzellen verbleiben nicht nur im Darm, sondern zirkulieren über die Blutbahnen durch den gesamten Körper. Bei Kontakt mit dem jeweiligen Krankheitserreger erfolgt die spezifische Bekämpfung des Pathogens. Durch die Zirkulation können die Immunzellen auch an anderen inneren Oberflächen wie die Schleimhaut der Atemwege oder der ableitenden Harnwege wirken, obwohl der Erstkontakt mit dem Krankheitserreger im Darm stattfand. Die Beschaffenheit der Darmflora und die Funktion des Immunsystems im Darm bedingt daher die Abwehrfähigkeit des gesamten Organismus.